马门溪龙的古生物学与古生态学
马门溪龙的头部类似梁龙，牙齿呈匙状，但与梁龙不同的是它们的牙齿布满嘴里，而梁龙的牙齿仅分布于嘴部前端。它们的四肢几乎一样长。马门溪龙具有很长的颈部，长度约在8到11米左右，颈部下方有很长的肋骨，颈椎数目在19节左右，远超越其他蜥脚类的颈椎数目。马门溪龙的颈椎长而细，但颈部并不灵活，主要借由与头部、肩部的关节来动作、弯曲。马门溪龙的大部份物种的化石都发现于四川省的沙溪庙组，地质年代为晚侏罗纪牛津阶至提通阶，约1亿6000万年前至1亿4500万年前。它们被认为与其他多种草食性恐龙生活在同一地区，例如蜥脚下目的峨嵋龙、剑龙类的沱江龙、重庆龙与嘉陵龙。同一地区的掠食性动物则有兽脚亚目的永川龙、四川龙。中加马门溪龙的化石则是发现于中国西北部的石树沟组，这里发现的其他恐龙还包含：大型肉食龙下目中华盗龙、原始的暴龙超科五彩冠龙、角鼻龙下目的泥潭龙、阿瓦拉慈龙超科的简手龙、剑龙下目的将军龙、以及基础角龙下目隐龙。
虚骨龙类的羽毛
化石证据显示大部分虚骨龙类可能拥有原始羽毛。R.Prum与A.H.Brush在一个2002年的研究宣称羽毛起源自虚骨龙类演化支，包含中华龙鸟与鸟类，而这些羽毛可能不存在于更原始的兽脚亚目生物群，例如：阿贝力龙超科、角鼻龙科、以及腔骨龙科。因此，羽毛是先进兽脚类恐龙的特征（例如虚骨龙类），并可能起源自这个生物群的最原始成员。另外，几乎每个虚骨龙类支系都有至少一个物种曾发现羽毛的化石痕迹。美颌龙科、暴龙超科、偷蛋龙下目、镰刀龙超科、阿瓦拉慈龙科、驰龙科、以及伤齿龙科都曾发现过羽毛痕迹。擅攀鸟龙科的所有标本都发现覆盖者羽毛。到目前为止，唯一没有发现直接羽毛证据的演化支是似鸟龙下目。在不计入现代鸟类的状况下，已发现的的虚骨龙类的羽毛结构原始、简易，某些虚骨龙类化石更发现了鳞片皮肤痕迹，包含：大型的暴龙科、侏罗猎龙、擅攀鸟龙。这些鳞片皮肤痕迹都位于后肢、尾巴部位，而擅攀鸟龙的化石同时也保存了羽毛痕迹，侏罗猎龙的化石周围，也有发现疑似原始羽毛的可疑痕迹。大部分虚骨龙类与现代鸟类的足部仍具有鳞片，少部分物种的足部覆盖者羽毛，例如近鸟龙，现代的岩雷鸟。大部分古生物学家将现代鸟类视为仅存的虚骨龙类（尤其是手盗龙类），但并非所有鸟类学家都这么认为。在过去，许多科学家认为只有虚骨龙类恐龙演化出羽毛，天宇龙。鸟臀目的管状毛与兽脚类的原始羽毛是否是同源演化的结果，或者是平行演化的特征，还没有结论。
