窃蛋龙目在虚骨龙类中的分类地位
窃蛋龙类普遍地被认为是非鸟兽脚类恐龙(Osborn,1924;Barsbold,1976a;Barsboldetal.,1990,2000a,b;Gauthier,1986;Sereno,1999a;Holtz,2000,2001;Norelletal.,2001b;Huangetal.,2002,2004;Xuetal.,2002b;Lüetal.,2004),因为在进步的窃蛋龙类中,无论它们的头骨还是头后骨骼都具有鸟类特征,所以它们曾经被认为是不会飞的鸟类(Paul,1988;Elzanowski,1995,1999;Lü,2000;Maryańskaetal.,2002;Lüetal.,2002)。Paul(1988)是第一位提出窃蛋龙类与现生鸟类的关系要比与始祖鸟密切得多的、不会飞行的鸟类的学者。Elzanowski(1995)比较了一窃蛋龙(Conchoraptorgracilis)和始祖鸟的腭部构造之后,提出窃蛋龙类和始祖鸟之间存在密切关系。他提出了窃蛋龙类、似鸟龙类、镰刀龙类和鸟类共同构成了一未解的四分支图(Elzanowski,1999;图16B)。可是在包括更多分类单元的分析中(包括所有虚骨龙类),窃蛋龙类并没有落入鸟类的范围之中(图13~15,18)。在进步的窃蛋龙类中没有发现有羽毛的证据,但是在原始的类群——邹氏尾羽龙中已经发现羽毛(Jietal.,1998;Zhou&Wang,2000;Zhouetal.,2000),并且羽毛也被认为出现在Avimimusportentosus中(Kurzanov,1987;Maryańskaetal.,2002)。邹氏尾羽龙的羽毛和始祖鸟以及圣贤孔子鸟(Confuciusornissanctus)的类似,而与镰刀龙类的皮肤结构不同(Xuetal.,1999;Maryańskaetal.,2002)。由趴卧在蛋巢之上的窃蛋龙类化石骨架所表明的孵卵行为(Norelletal.,1995;Dong&Currie,1996;Clarketal.,1999)与现生鸟类的类似,而且窃蛋龙蛋壳的微观结构与平胸鸟类的窄小管状(angusticanaliculate)一样(Norelletal.,1994),而在最原始的窃蛋龙——戈氏切齿龙(Xuetal.,2002b)没有观察到在进步窃蛋龙类中体现的鸟类特征,所以,进步窃蛋龙类所具有的鸟类特征的最简约解释是它们由与鸟类的趋同演化所致。
虚骨龙类的羽毛
化石证据显示大部分虚骨龙类可能拥有原始羽毛。R.Prum与A.H.Brush在一个2002年的研究宣称羽毛起源自虚骨龙类演化支,包含中华龙鸟与鸟类,而这些羽毛可能不存在于更原始的兽脚亚目生物群,例如:阿贝力龙超科、角鼻龙科、以及腔骨龙科。因此,羽毛是先进兽脚类恐龙的特征(例如虚骨龙类),并可能起源自这个生物群的最原始成员。另外,几乎每个虚骨龙类支系都有至少一个物种曾发现羽毛的化石痕迹。美颌龙科、暴龙超科、偷蛋龙下目、镰刀龙超科、阿瓦拉慈龙科、驰龙科、以及伤齿龙科都曾发现过羽毛痕迹。擅攀鸟龙科的所有标本都发现覆盖者羽毛。到目前为止,唯一没有发现直接羽毛证据的演化支是似鸟龙下目。在不计入现代鸟类的状况下,已发现的的虚骨龙类的羽毛结构原始、简易,某些虚骨龙类化石更发现了鳞片皮肤痕迹,包含:大型的暴龙科、侏罗猎龙、擅攀鸟龙。这些鳞片皮肤痕迹都位于后肢、尾巴部位,而擅攀鸟龙的化石同时也保存了羽毛痕迹,侏罗猎龙的化石周围,也有发现疑似原始羽毛的可疑痕迹。大部分虚骨龙类与现代鸟类的足部仍具有鳞片,少部分物种的足部覆盖者羽毛,例如近鸟龙,现代的岩雷鸟。大部分古生物学家将现代鸟类视为仅存的虚骨龙类(尤其是手盗龙类),但并非所有鸟类学家都这么认为。在过去,许多科学家认为只有虚骨龙类恐龙演化出羽毛,天宇龙。鸟臀目的管状毛与兽脚类的原始羽毛是否是同源演化的结果,或者是平行演化的特征,还没有结论。