肉足虫纲的物种分目
根据伪足的不同可将肉足虫纲分为两个亚纲。根足亚纲（Rhizopoda）伪足为叶型、丝型、根型，但无轴型，淡水或海水生活，极少数寄生于昆虫、脊椎动物及人体消化道内。（1）变形虫目（Amoebina）身体裸露、体形随原生质流动而改变，同时形成伪足。伪足叶型，包囊形成普遍。多数种类淡水生活，少数海洋生活，例如常见的大变形虫，棘变形虫（Acanthamoeba），哈氏变形虫（Hartmannella）。极少数变形虫寄生于无脊椎动物及脊椎动物体内，例如寄生于白蚁及蛩蠊体内的内变形虫（Endamoeba）、寄生于人体肠道内的痢疾内变形虫（Entamoebahistolytic）。痢疾内变形虫生活史中有滋养体（trophozoite）及包囊（cyst）阶段。包囊是传播阶段，其中有四个核，当人误食了包囊之后，在人小肠内包囊破裂，四个细胞核释出，并形成小滋养体，小滋养体在肠腔中以细菌为食，行无性繁殖形成更多的小滋养体或大滋养体。大滋养体侵入肠壁，溶解肠组织，吞噬组织和红血细胞，造成肠壁脓肿，大便脓血。所以也称为阿米巴痢疾，或赤痢。大滋养体还可侵入肝、肺等器官，并造成该器官的脓肿，在肠内只有小滋养体可以形成包囊，随寄主粪便排出体外，进行传播。（2）有壳目（Testacea）体外具几丁质或拟壳质构成的单室壳，或体外有粘液粘着砂粒等外来物形成砂质壳。壳的一端具有大孔，伪足由此孔伸出，伪足叶型或丝形。无性生殖是纵二分裂或横二分裂。有性生殖是异配生殖，但配子也呈变形虫状。包囊现象也很普遍，主要分布在淡水、海水、潮湿土壤的表面，常见的代表种有表壳虫（Arcellavulgaris），壳半圆形、黄褐色，虫体伸出原生质丝以固着在壳内。鳞壳虫（Euglyphastrigosa）。壳由硅质板组成，壳上伸出长刺。砂壳虫（Difflugiaoblonga）是由外来砂粒被胶质粘合形成的壳，壳内虫体结构与变形虫相似。（3）有孔虫目（Foraminiferida）具有碳酸钙或拟壳质构成的单室壳或多室壳，壳的形状多种，有节房虫型、圆线型、球型、瓶型、螺旋型等等。多室壳是由胚壳室按一定方向及排列连续分泌形成。壳内各室之间有钙质板相隔，但板上有小孔，使壳室内的原生质彼此相连。壳内的细胞质中含有一个到多个细胞核，壳室的外表面包有一层极薄的外质，通过壳口及壳外的原生质伸出伪足，伪足根型。极少数为淡水生活，例如异网足虫（Allogromia），具单壳。绝大多数为海洋生活，如球房虫（Globigerina）等。有人估计有孔虫约有20000种之多。大多数有孔虫在海洋中底栖或漂浮生活，它们的壳及尸体在海底形成有孔虫软泥，覆盖了世界海洋的1/3海底，深度约在4000m之内。超过此限度由于水的更大压力及更高浓度的CO2，容易将钙质壳溶解掉。辐足亚纲（Actinopoda）具轴型伪足，淡水和海水生活，多数营漂浮生活。（1）太阳虫目（Heliozoa）体呈球型，主要在淡水中营漂浮生活，具轴型伪足，伪足上有成排的颗粒，伪足主要是作为捕食细胞器。细胞质可以明显的分为高度泡化的外层和具颗粒的致密的内层。外层中含有一到几个伸缩泡，内层中具有食物泡及细胞核以及共生的藻类等。一些种类还有拟壳质的囊包围在虫体之外，常见的种类如辐球虫（Actinosphaerium），太阳虫（Actinophryssol）等。（2）放射虫目（Radiolaria）虫体亦呈球型，最大的虫体直径可达5mm。全部为海洋漂浮生活，体内具有几丁质或拟壳质构成的中心囊，中心囊将细胞质分为内、外两部分，囊外部分具有粘着物质包围形成的许多大的粘泡，其中充满粘液。囊外部分具有营养功能，囊内部分有生殖功能，实际上中心囊上有小孔，使内、外的原生质可以相沟通。伪足亦为轴型，个别种亦有丝型。有的种亦有硅质或硫酸锶构成的网格状外壳包围在体表。有放射状的长骨针由虫体的中央向四周伸出，与外表的网格壳共同构成骨骼。单核或多核，核位于囊内，放射虫在海底亦可形成放射虫软泥，它可以比有孔虫软泥分布在更深的海底，因为它的壳不是碳酸钙而是有机质，能承受更大的海水压力，代表种如等棘虫（Acanthometraelasticum）、锯六锥星虫（Hexaconusserratus）。
如何区别纤毛虫纲、鞭毛虫纲、肉足虫纲3类原生动物
纤毛虫纲的原生动物成体或生活周期的某个时期具有纤毛，以纤毛为其运动及取食的细胞器。纤毛虫都具有两种类型的细胞核，即大核与小核。大核与细胞的RNA合成有关，也称营养核（vegetativenucleus），小核与细胞的DNA合成有关，也称生殖核（reproductionnucleus）。无性生殖行横分裂，有性生殖为接合生殖。鞭毛纲：形态：身体通常具鞭毛，以鞭毛为运动细胞器，鞭毛常为1－2条，少数种类有多条。营养方式：有的自养，有的异养。自养：体内有叶绿体，能通过光合作用制造营养物质。异养：有两种形式：渗透营养（osmotrophy），也称腐生营养。吞噬营养（phagotrophy），也称动物性营养。繁殖：分有性和无性繁殖2类：无性繁殖：一般为纵二裂。有性繁殖：配子结合或整个个体结合。肉足纲：身体无一定形状，即虫体表面的任何部位都可以形成临时性凸起，称伪足。伪足有摄食和运动的功能。靠伪足的运动称变形运动。
