肉足虫纲的物种分目
根据伪足的不同可将肉足虫纲分为两个亚纲。根足亚纲（Rhizopoda）伪足为叶型、丝型、根型，但无轴型，淡水或海水生活，极少数寄生于昆虫、脊椎动物及人体消化道内。（1）变形虫目（Amoebina）身体裸露、体形随原生质流动而改变，同时形成伪足。伪足叶型，包囊形成普遍。多数种类淡水生活，少数海洋生活，例如常见的大变形虫，棘变形虫（Acanthamoeba），哈氏变形虫（Hartmannella）。极少数变形虫寄生于无脊椎动物及脊椎动物体内，例如寄生于白蚁及蛩蠊体内的内变形虫（Endamoeba）、寄生于人体肠道内的痢疾内变形虫（Entamoebahistolytic）。痢疾内变形虫生活史中有滋养体（trophozoite）及包囊（cyst）阶段。包囊是传播阶段，其中有四个核，当人误食了包囊之后，在人小肠内包囊破裂，四个细胞核释出，并形成小滋养体，小滋养体在肠腔中以细菌为食，行无性繁殖形成更多的小滋养体或大滋养体。大滋养体侵入肠壁，溶解肠组织，吞噬组织和红血细胞，造成肠壁脓肿，大便脓血。所以也称为阿米巴痢疾，或赤痢。大滋养体还可侵入肝、肺等器官，并造成该器官的脓肿，在肠内只有小滋养体可以形成包囊，随寄主粪便排出体外，进行传播。（2）有壳目（Testacea）体外具几丁质或拟壳质构成的单室壳，或体外有粘液粘着砂粒等外来物形成砂质壳。壳的一端具有大孔，伪足由此孔伸出，伪足叶型或丝形。无性生殖是纵二分裂或横二分裂。有性生殖是异配生殖，但配子也呈变形虫状。包囊现象也很普遍，主要分布在淡水、海水、潮湿土壤的表面，常见的代表种有表壳虫（Arcellavulgaris），壳半圆形、黄褐色，虫体伸出原生质丝以固着在壳内。鳞壳虫（Euglyphastrigosa）。壳由硅质板组成，壳上伸出长刺。砂壳虫（Difflugiaoblonga）是由外来砂粒被胶质粘合形成的壳，壳内虫体结构与变形虫相似。（3）有孔虫目（Foraminiferida）具有碳酸钙或拟壳质构成的单室壳或多室壳，壳的形状多种，有节房虫型、圆线型、球型、瓶型、螺旋型等等。多室壳是由胚壳室按一定方向及排列连续分泌形成。壳内各室之间有钙质板相隔，但板上有小孔，使壳室内的原生质彼此相连。壳内的细胞质中含有一个到多个细胞核，壳室的外表面包有一层极薄的外质，通过壳口及壳外的原生质伸出伪足，伪足根型。极少数为淡水生活，例如异网足虫（Allogromia），具单壳。绝大多数为海洋生活，如球房虫（Globigerina）等。有人估计有孔虫约有20000种之多。大多数有孔虫在海洋中底栖或漂浮生活，它们的壳及尸体在海底形成有孔虫软泥，覆盖了世界海洋的1/3海底，深度约在4000m之内。超过此限度由于水的更大压力及更高浓度的CO2，容易将钙质壳溶解掉。辐足亚纲（Actinopoda）具轴型伪足，淡水和海水生活，多数营漂浮生活。（1）太阳虫目（Heliozoa）体呈球型，主要在淡水中营漂浮生活，具轴型伪足，伪足上有成排的颗粒，伪足主要是作为捕食细胞器。细胞质可以明显的分为高度泡化的外层和具颗粒的致密的内层。外层中含有一到几个伸缩泡，内层中具有食物泡及细胞核以及共生的藻类等。一些种类还有拟壳质的囊包围在虫体之外，常见的种类如辐球虫（Actinosphaerium），太阳虫（Actinophryssol）等。（2）放射虫目（Radiolaria）虫体亦呈球型，最大的虫体直径可达5mm。全部为海洋漂浮生活，体内具有几丁质或拟壳质构成的中心囊，中心囊将细胞质分为内、外两部分，囊外部分具有粘着物质包围形成的许多大的粘泡，其中充满粘液。囊外部分具有营养功能，囊内部分有生殖功能，实际上中心囊上有小孔，使内、外的原生质可以相沟通。伪足亦为轴型，个别种亦有丝型。有的种亦有硅质或硫酸锶构成的网格状外壳包围在体表。有放射状的长骨针由虫体的中央向四周伸出，与外表的网格壳共同构成骨骼。单核或多核，核位于囊内，放射虫在海底亦可形成放射虫软泥，它可以比有孔虫软泥分布在更深的海底，因为它的壳不是碳酸钙而是有机质，能承受更大的海水压力，代表种如等棘虫（Acanthometraelasticum）、锯六锥星虫（Hexaconusserratus）。
顶复动物亚门的形态
一般可分为透明、致密的外质和液态、流动的内质。细胞质中含有各种颗粒（油滴、淀粉、副淀粉、色素等）和各种细胞器（线粒体、高尔基器、溶酶体等）。高尔基器在鞭毛虫中很多，在纤毛虫中缺如或不发达。高尔基器与细胞合成产物的精制、加工和储存有关，如在合尾滴虫、鳞壳虫、放射虫等体表呈图案排列的鳞片，这些鳞片就是在高尔基器的泡囊内形成的，然后这些泡囊移到内质膜，鳞片再按一定的图案排列在体表面。电镜观察揭示大多数纤毛虫的线粒体的内膜向内突入，形成管状的嵴，但在一些鞭毛虫是片状或盘状嵴，在变形虫和簇虫是泡囊嵴。寄生在反刍动物胃中的厌氧纤毛虫的线粒体是没有嵴的囊，肠袋虫的线粒体则是有嵴与无嵴的混合体。许多植物性鞭毛虫和某些其他原生动物有呈红-紫色的色素颗粒，称为血色素，如雨红球虫、吉尼眼虫、红眼虫、赭虫。天蓝喇叭虫的外质含有1种喇叭色素，因而虫呈蓝色。根据染色质的构造可把细胞核分为泡状核和致密核两类（图1）。泡状核常见于肉足虫和鞭毛虫，致密核常见于纤毛虫的大核中。在鞭毛虫、肉足虫、孢子虫中，有的种类有很多细胞核，但都是同型核。许多原生动物在营养期间，细胞核的染色体是多倍体，有些则为二倍体或单倍体。纤毛虫有大、小核之分，小核是二倍体，大核是高度多倍体。大核的大小、形状、数量变化很大，在形状上也各不相同差异很大。大、小核内均含脱氧核糖核酸（DNA）。一般地说小核控制细胞的遗传，大核控制细胞的营养，但这不是绝对的。已知大核在遗传上能控制表型（见基因），说明大核中也有某些控制遗传的因子。只有大核而没有小核的品系虽然能分裂和生存，但最后还是会老化。在接合生殖过程中，大核退化，由小核产生新的大核，这说明大核虽有自主性，但仍要依赖小核。纤毛虫的核二型性在整个生物界是独特的。鞭毛虫的细胞核与毛基体系统有密切关系。鞭毛的基体有根丝体联系到核上。基体与核在数量上有一定比例。在低等的鞭毛虫中一般为2∶1，即2个基体，1个细胞核。随着进化而扩大比例，在超鞭毛目中已是100～1000∶1了。大部分植物性鞭毛虫具有与光合作用有关的色素体和红色的眼点。眼点由1至多个红色小球构成，对光十分敏感，能引导鞭毛虫游向阳光处。色素体有4类：叶绿素、胡萝卜素、叶黄素和藻胆素。由于所含色素体的组成和分量不同，植物性鞭毛虫在颜色上差异很大，有绿、黄、蓝等。有色鞭毛虫如长期处在黑暗而有机质丰富的环境中，色素体和眼点都退色，不再进行光合作用，它们用身体表面的渗透功能吸收营养或直接通过胞口吞入食物（如眼虫）。与鞭毛虫、肉足虫、纤毛虫相应的运动胞器有鞭毛、伪足和纤毛。孢子虫是寄生的，无专门的运动胞器，借身体的屈曲、滑动等方式移动，仅在生活史中的变形期，其小配子可借伪足和鞭毛运动。鞭毛虫中除超鞭毛虫有许多鞭毛外，一般常为1～2根，少数有8根。鞭毛是细胞质的丝状突起，通常自身体前端伸出，少数自体侧、腰沟、体后伸出成舵鞭毛。鞭毛还有捕食、附着、感觉的功能。它由两部分组成：中央为1根有弹性的、由若干平行的纤维组成的轴丝，轴丝外部包着原生质鞘（图2）。原生动物中的鞭毛和一切真核生物中的鞭毛一样，是“9+2”的格式（见鞭毛与纤毛）。鞭毛是从表膜下埋在细胞质内的、可染色的毛基体亦称基体，在纤毛虫中称为动基体延伸到体外。一般鞭毛虫有2个基体，位在细胞顶端，但只有一个基体上伸出一根鞭毛，另一个基体是秃的（如低等的锥虫）或有一点鞭毛的痕迹（如眼虫）。在较高等的动鞭毛虫中，基体可有2、6、8甚至数百个不等。在超鞭毛虫中有2000根左右的鞭毛，基体数量总比鞭毛多5个，这5个不长鞭毛的基体在个体发育上具有重要的意义。基体本身不分裂，新的基体在靠近原有的基体处形成。电子显微镜观察证实基体的外周微管排列格式与鞭毛相似，只是在双重体中增加了第3根，成为三重体（图3f、g）。在寄生的鞭毛虫中与鞭毛有关的构造还有波动膜、肋、脊突、副基器、副基丝、轴杆、盾、锤、纺锤簇等。鞭毛自顶端向基部作波浪运动，有平面的和螺旋的两种波浪运动形式，均可使虫体向任何方向移动。伪足根据形态可分为叶足、丝足、根足（又称网足）和轴足四类。伪足除了行动之外，还有捕食、固着、感觉的功能。关于伪足的变形运动已研究了100多年，至今仍未解决。一般认为当变形虫行动时，内质从半液态的溶胶转化为半固态的凝胶，凝胶有收缩性，它对溶胶产生微压，于是溶胶便向最薄弱的地方流去，并形成伪足。因此伪足象个凝胶管，溶胶被迫向管子流去。溶胶达到凝胶管前端接近表膜处就转化为凝胶。在后部收缩的凝胶又转化为新的溶胶（图4）。如此不断重复，溶胶不断向前流动，身体后部就不断缩小，结果伪足便增大而成为身体的主要部分，同时前面又不断形成新的伪足。这种变形运动常见于叶足型的种类。丝足、网足、轴足的运动便是另一形式，因为这类伪足很细，中央有较硬的纤维，溶胶象传送带似地沿着纤维向两个相反方向流动。纤毛与鞭毛一样，也是由轴丝和鞘组成，轴丝的亚显微结构也是按“9+2”的格式排列（图5）。每根纤毛的基体伸出一细纤维，位于基体的左边，并与同一行列内其他纤毛基体伸出的纤丝相连结，成为纵行的动纤丝。纤毛比鞭毛短而数量多。纤毛有运动、捕食和感觉的功能，而且随分工不同而特化。有的纤毛愈合成小膜，在口缘成带状排列，动作有力而协调，便于将食物驱入口中。有的纤毛愈合成大的波动膜，突出在口缘之外。在下毛类中，背部纤毛退化，腹部纤毛融合成毛笔状的棘毛。原生动物中运动最快的是纤毛虫。每根纤毛在打水时，分效力击打和恢复击打两种。整个纤毛的协调击打、沿着身体产生4种类型的节律波。这类胞器是细胞外的构造，如柄、壳、内外骨骼、孢囊、孢子等，这些结构是多细胞动物所没有的。属于内骨骼的如动鞭毛虫的轴杆、肋，放射虫辐射伸出的刺或骨针，裸口类纤毛虫口器内的咽篮、刺杆等，多半是起支持和保护的作用。属于外骨骼最常见的是在加厚的表膜外有一层保护的壳。壳有几丁质、硅质、硫酸锶等成分，有时还有石灰质沉淀。有的壳是整片的，有的是鳞片状的，有的有精美雕刻的图案。原生动物还能从自体内射出各种突出质，用以进行防卫、攻击和取食。纤毛虫有7种突出质：刺丝泡（如草履虫）、粘丝泡（如四膜虫）、毒丝泡（如长颈虫）、系丝泡（在吸管虫的触手上）、纤丝泡（如拟小胸虫）、杆丝泡（如管刺虫）和网丝泡（如栉毛虫）。鞭毛虫中也有刺丝泡和粘丝泡，如腰鞭毛虫有刺丝囊、粘孢子虫有极丝，它们起着固着的作用。生活在淡水的原生动物有1至多个伸缩泡生活在海水中的和寄生的原生动物一般没有伸缩泡。变形虫只有1个伸缩泡，构造简单，位置不定，伸缩泡的周围有小囊泡，线粒体密度较大（图6）。草履虫有前后两个伸缩泡，各有1个中央泡和6根辐射伸出的收集管，收集管上有分枝小管与内质网的管道系统相连（图6）。伸缩泡的主要功能是调节渗透压。食物泡恨据摄食情况分为两种：含大颗粒食物的吞噬泡和含溶解性营养物质的吞饮泡。食物颗粒或营养物质进入食物泡后，食物泡与细胞质内的溶酶体合并，食物被溶酶体释放的酶消化，未经消化的废物被排出体外。原生动物的生命周期包括生殖期和孢囊。有些种类已失去形成孢囊的能力。生殖期可分为无性生殖和有性生殖。大多数原生动物无性生殖用二分裂法。鞭毛虫是纵分裂，纤毛虫是横分裂。缘毛类纤毛虫外表看来如纵分裂，但是细胞内各成分（如核、口围纤毛带）仍是横分裂（图7）。疟原虫、球虫则行裂体生殖（复分裂）。吸管虫在体内或体外生出许多芽体（出芽）。有些多核的原生动物如胶丝虫、多核变形虫偶尔会分裂成2至数个小的、仍是多核的个体（原生质团分割）。以上4种方式只有出芽生殖还保留亲体，其余均无亲体，后代都是等同的。原生动物有性生殖有3种：融合、接合、自体受精和假配。自体受精与接合生殖相似，但只在一个个体内进行。小核分裂数次，其中有两个配子核融合成合核，其余退化。合核分裂形成新的大、小核。假配与接合生殖一样，要求两个个体接触，但没有配子核的交换，每个个体完成自体受精过程后各自分开。在草履虫中曾发现过这两种特殊的核现象。寄生原生动物的生活史比较复杂。大多数孢子生活史包括3个时期：裂体生殖期、配子生殖期和孢子生殖期。有明显的无性世代与有性世代的交替。孢子生殖期是由合子产生的孢子母细胞形成孢子后，再进一步形成子孢子。子孢子一般包有外壳，能抵抗不良环境，有利于传布。
